ABSTRACT
Our study focuses on the molecular analysis of the genetic diversity within 15 Tunisian durum wheat varieties and the assessment of the efficiency of some available markers to select valuable genotypes for technological proprieties of semolina (i.e. parameters related to SDS-sedimentation, mixing time and breakdown resistance of mixograph, grain protein content and yellow colour). While several markers were validated, others were not informative within the genotypes used. A high level of polymorphic information content (PIC) was detected, with an average of 5.2 polymorph alleles per locus and 0.6 average. Old varieties have high protein content however; modern varieties display strong gluten strength. Our results thus open the opportunity to choose valuable parents on the base of pedigrees, technological properties and genetic distances; and lead us to select efficient markers for the Regional Indigenous Land Strategy (Rils) selection strategy
Nosso estudo enfoca a análise molecular da diversidade genética em 15 variedades de trigo duro tunisiano e a avaliação da eficiência de alguns marcadores disponíveis para selecionar genótipos valiosos para propriedades tecnológicas de semolina (ou seja, parâmetros relacionados à sedimentação sds, tempo de mistura e resistência à degradação do mixógrafo, teor de proteína dos grãos e cor amarela). Enquanto vários marcadores foram validados, outros não foram informativos dentro dos genótipos utilizados. Foi detectado um alto nível de conteúdo de informação polimórfica (pic), com uma média de 5,2 alelos polimórficos por locus e 0,6 média. Variedades antigas têm alto teor de proteína no entanto; variedades modernas exibem forte força de glúten. Nossos resultados abrem, assim, a oportunidade de escolher pais valiosos com base em pedigrees, propriedades tecnológicas e distâncias genéticas; e nos levam a selecionar marcadores eficientes para a estratégia de seleção da estratégia regional de terras indígenas (rils).
Subject(s)
Genetic Variation , TriticumABSTRACT
The genetic diversity of a set of 21 hexaploid wheat germplasm from the National Agronomic Institute of Tunisia were investigated by applying 26 agro morphological traits and 10 wheat microsatellites molecular markers (Simple Sequence Repeat). The morphological variability was analyzed using the Principal Component Analysis (PCA) and the cluster analysis based on ward's method and square Euclidean distance. Eighteen microsatellites primer pairs were tested for all genotypes, among them 10 primers generated polymorphic and reproducible profiles. They revealed a total of 414 reducible bands among which 373 were polymorphic. The polymorphic information content (PIC) values per locus varied from 0,33 to 0,94 with an average of 0,72. Genetic similarity values between genotypes, calculated by the molecular derived data, were used to produce a dendrogram. The genotypes were clustered in four clear groups according to their origin, pedigree and in some cases to phenotypic characters similarities.
A diversidade genética de um conjunto de 21 hexaplóides em germoplasma de trigo oriundo do Instituto Nacional da Tunísia foi investigada pela aplicação de 26 caracteres morfológicos e 10 marcadores de microsatélites (Sequências simples repetidas). A variabilidade morfológica foi analisada pelo uso da análise de componentes principais (ACP) e análise de agrupamento baseada no método de Ward e o quadrado da distância Euclidiana. Dezoito primers de microsatélites foram testados para todos os genótipos, entre os quais 10 geraram polimorfismo e grupos distintos. Eles demonstraram um total de 414 bandas entre as quais 373 foram polimórficas. Os valores de polimorfismo encontrados por locus (VPL) variaram entre 0,33 a 0,94 com uma média de 0,72. Os valores da similaridade genética calculada para os dados moleculares originaram um dendograma. Os genótipos foram agrupados em quatro grupos de acordo com sua origem, pedigree (descendência) e em alguns casos pelos caracteres da similaridade fenotípica.